Defragmenteren is een ander woord voor alle fragmenten van bestandjes en programma's weer eens netjes rangschikken op de harde schijf. Als dat gebeurt is, kan Windows alles weer goed en snel vinden, en staat de boel niet meer in stukjes en beetjes verspreid op de harde schijf. Een harde schijf bestaat uit een harde ronde schijf, met daarop opgedampt een magnetisch materiaal, net als een cassette bandje, wat weer is onderverdeeld in cirkel vormige sporen, die weer onderverdeeld zijn in segmenten. Een stukje spoor tussen twee segmenten (het rode stukje) wordt een cluster genoemd

Dit defragmenteren moet je niet overdrijven, maar een keer per maand, of een keer of 4 per jaar is wel aan te bevelen. Een harde schijf raakt na enige tijd gefragmenteerd door veelvuldig bestandjes erop te schrijven en weer te verwijderen. Door intensief gebruik dus.